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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-20 08:50:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Sequence 33806 from Patent EP2761003.
JC648025.1:479-506
TGTGTTTTGTATACAATTGTGCAAAATACT479TGTGCTCATGTTAATTGGTTTGGTGTATATATATGGAAAACTTCCAAATAGAGTTCGC
T135797b shotgun sub-library of BAC clone 60O16 Medicago truncatula genomic clone 60-O-16-C-029, genomic survey sequence.
AQ580197.1:474-501
GCGAACTCTATTTGGAAGTTTTCCATATAT474ATACACCAAACCAATTAACATGAGCACAAGTATTTTGCACAATTGTATACAAAACACA
Medicago truncatula clone mth2-9i24, complete sequence.
AC126785.11:37510-37537
GCGAACTCTATTTGGAAGTTTTCCATATAT37510ATACACCAAACCAATTAACATGAGCACAAGTATTTTGCACAATTGTATACAAAACACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGTGCTCATGTTAATTGGTTTGGTGTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGTGCTCATGTTAATTGGTTTGGTGTAT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.146 | 0.137 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTGCTCATGTTAATTGGTTTGGTGTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.164 | 0.018 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATACACCAAACCAATTAACATGAGCACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.166 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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