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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 14:27:42, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Coregonus sp. 'balchen' genome assembly, chromosome: 24.
LR778276.1:32265152-32265173
CTTCTTCCCCTATCTCTACTGCATCTCTCT32265152TTCTATTCTCTCTGTCCCTCTCTCTATCTCACTTTGCCATTCTCAGCGGCAT
Coregonus sp. 'balchen' genome assembly, chromosome: 24.
LR778276.1:32274397-32274418
CTTCTTCCCCTATCTCTACTGCATCTCTCT32274397TTCTATTCTCTCTGTCCCTCTCTCTATCTCACTTTGCCATTCTCAGCGGCAT
Aquila chrysaetos chrysaetos genome assembly, chromosome: 4.
LR606184.1:56234351-56234372
GCACCTGGGGCTGCAAAGCCTAGACAGGAT56234351GAGAGGGACAGAGAGAATAGAATTACAGCAGTTGCCAAGTAGTATAATTGAA
TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig13077.UPAS mRNA sequence.
EZ630794.1:479-500
AAAACTGAAATTAATAATAATGAAAGGTGG479GAGAGGGACAGAGAGAATAGAATAGTAAGAATATATAAAGGAAATTAGTGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCTATTCTCTCTGTCCCTCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCTATTCTCTCTGTCCCTCTC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.116 | 0.108 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCTATTCTCTCTGTCCCTCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.148 | 0.031 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGAGGGACAGAGAGAATAGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.149 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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