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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 05:37:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B05.
CP030997.1:149514494-149514513
CCCGAGGAGCAGGTTGAGGCTGTGCAGGGT149514494TTGACTCTCACTGCAGATGGAAATGGTGCAGTGTTTGATGTACCAGCCAA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 05.
CP049896.1:157038089-157038108
CCCGAGGAGCAGGTTGAGGCTGTGCAGGGT157038089TTGACTCTCACTGCAGATGGAAATGGTGCAGTGTTTGATGTACCAGCCAA
Pipistrellus pipistrellus genome assembly, chromosome: 8.
LR862364.1:36322488-36322507
CAGCGCAGAGGAGTCAGTCCTGGGTCCTGG36322488CCATCTGCAGTGAGAGTCAATCCTGGACTCAGGACTGACTCCCACAGCAG
Arachis hypogaea EST, cultivar Minhua6, clone GFBZZHF01DBOTZ.
LN678237.1:472-491
TTGGCTGGTACATCAAACACTGCACCATTT472CCATCTGCAGTGAGAGTCAAACCCTGCACAGCCTCAACCTGCT
TSA: Arachis hypogaea CL1Contig712.Arhy mRNA sequence.
EZ721696.1:708-727
TTGGCTGGTACATCAAACACTGCACCATTT708CCATCTGCAGTGAGAGTCAAACCCTGCACAGCCTCAACCTGCTCCTCGGG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A05.
CP030987.1:86359245-86359264
TTGGCTGGTACATCAAACACTGCACCATTT86359245CCATCTGCAGTGAGAGTCAAACCCTGCACAGCCTCAACCTGCTCCTCGGG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B09.
CP031001.1:149175461-149175480
CTTGACTAGCACAACAAACACTGCACCATT149175461CCATCTGCAGTGAGAGTCAAATCCTGCACAGCCTCAACCTGCTACTTGGA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 09.
CP049900.1:148032617-148032636
CTTGACTAGCACAACAAACACTGCACCATT148032617CCATCTGCAGTGAGAGTCAAATCCTGCACAGCCTCAACCTGCTACTTGGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGACTCTCACTGCAGATGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGACTCTCACTGCAGATGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.096 | 0.088 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGACTCTCACTGCAGATGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.288 | 0.191 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCATCTGCAGTGAGAGTCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.291 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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