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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 08:14:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Meles meles genome assembly, chromosome: 3.
OV277443.1:78915277-78915296
CTGTCAGTTCCAAGGAGGGCGAGATTTCAT78915277TTGTAACCCTCTCAATCCCCCACTGCTTTGTTTACAGGTGGGAGGAGGGA
ZMMBBb0627E13f ZMMBBb (HindIII) Zea mays subsp. mays genomic clone ZMMBBb0627E13 5', genomic survey sequence.
CL284571.1:516-535
GGATTGAGGGAGATTTTGATTTACTAGGTA516TTGTAACCCTCTCAATCCCCCCTCAATCCATGGATTGAGGTAGAACCGAA
Atr01b_105_H09_C010.b1 FGP Male Amborella trichopoda Amborella trichopoda cDNA clone 122L0d_P17 3', mRNA sequence.
FD431010.1:415-434
TGTTCTTCACACTTTTGTGATCAAATCTCT415GGGGATTGAGAGGGTTACAAAGGACAAGTTGGTTTCTGCCCTTTCTAAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGTAACCCTCTCAATCCCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGTAACCCTCTCAATCCCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.121 | 0.113 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGTAACCCTCTCAATCCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.210 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGGATTGAGAGGGTTACAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.211 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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