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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-04 09:53:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 3.
CP025646.1:27099059-27099082
GTTGAAGTGCTAGCATGAGTTCTTCACTAA27099059AGGGATCTGCAAATACAGGACTGCTGGTACTGTATACATCTATAGCTGCTGCCA
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf44m16, 5' end.
CJ754732.1:254-277
TGGCAGCAGCTATAGATGTATACAGTAGCA254GCAGTCCTGTATTTGCAGATCCCTTTAGTGAAGAACTCATGCTAGCACTTCAAC
TSA: Ipomoea batatas Contig_43304.Ipbalsr mRNA sequence.
JP147892.1:120-143
TGGCAGCAGCTATAGATGTATACAGTAGCA120GCAGTCCTGTATTTGCAGATCCCTTTAGTGAAGAACTCATGCTAGCACTTCAAC
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 3.
CP025662.1:8113072-8113095
TGGCAGCAGCTATAGATGTATACAGTAGCA8113072GCAGTCCTGTATTTGCAGATCCCTTTAGTGAAGAACTCATGCTAGCACTTCAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/agggatctgcaaatacaggactgc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : agggatctgcaaatacaggactgc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.093 | 0.084 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGGATCTGCAAATACAGGACTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.154 | 0.061 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGTCCTGTATTTGCAGATCCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.156 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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