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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-06 05:57:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Sylvilagus floridanus genome assembly, chromosome: 15.
OX463237.1:11330052-11330072
GCTTCAAAGTCACAAAAGATATGCCCTTTA11330052ATTTCAAGATAACGTGCCTAACCCTACATCAAACTCACTATGCGTCTGGAC
Meleagris gallopavo genome assembly, chromosome: Z.
OW982255.1:14711006-14711026
TTAAAATCAAGCAAACAGCAACAAACTTAG14711006ATTTCAAGATAACGTGCCTAAATATTGGTTTAGTTTTTATACTGGTGAGGT
Meleagris gallopavo genome assembly, chromosome: Z.
OW982294.1:14795686-14795706
TTAAAATCAAGCAAACAGCAACAAACTTAG14795686ATTTCAAGATAACGTGCCTAAATATTGGTTTAGTTTTTATACTGGTGAGGT
Citrus sinensis genome assembly, chromosome: 8.
OY754325.1:612885-612905
CCCAAACAAGTCCAACCGCTACTTCTAAAA612885ATTTCAAGATAACGTGCCTAAAGAACTTCCTAACAAGTTACCTCCTATGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/atttcaagataacgtgcctaa
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : atttcaagataacgtgcctaa | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.109 | 0.100 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTTCAAGATAACGTGCCTAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.126 | 0.017 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTAGGCACGTTATCTTGAAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.126 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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