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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-08 19:59:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Ipomoea nil cDNA clone:jmsf4e04, 5' end.
CJ750263.1:123-146
GAGTGCNGGANTGAAGCNTGTCATCCTTCA123TATCACCACTCCCAAGTCCCAAGTAGTTTGCTTTAATTTCTTAAATCCNAGTTT
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf5e04, 5' end.
CJ751700.1:123-146
GAGTGCNNGATTGAAGCNTGTCNTCCTTCA123TATCACCACTCCCAAGTCCCAAGTAGTTTGCTTTAATTTCTTAAATCCNAGTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/tatcaccactcccaagtcccaagt
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : tatcaccactcccaagtcccaagt | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.147 | 0.138 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATCACCACTCCCAAGTCCCAAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.162 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTTGGGACTTGGGAGTGGTGATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.163 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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