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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-05 21:13:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arvicola amphibius genome assembly, chromosome: 5.
LR862384.1:131411179-131411198
TATTTTAAGTTTTAAAAATAGATATGGTTG131411179AAAAATGATCTGTATGTTGCTCATTCCCTATGGCCTCTTGAGGTGAATGT
Bombus hypnorum genome assembly, chromosome: 1.
OU427020.1:2382356-2382375
GCGAGCCCACAGTGTAATGAAATTGATATA2382356AAAAATGATCTGTATGTTGCTTTATTGTCGAATGAAAATTAATTGACAGT
Teleiodes luculella genome assembly, chromosome: 9.
OX419591.1:4770579-4770598
TTTCCGTTATTTAGGTTAAGAAACACTAAC4770579AAAAATGATCTGTATGTTGCCTGAATAAATAAGAACATTATTATTATTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAAAATGATCTGTATGTTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAAAATGATCTGTATGTTGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.347 | 0.338 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAAATGATCTGTATGTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.426 | 0.079 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAACATACAGATCATTTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.426 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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