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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:10:56, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 11.
CP124721.1:2821493-2821513
TCCTACACTAACATATTTTTTCAATCTTTA2821493AAAAGGAAGGTTCTCATTGTTGCATTGTTGCTACTACTGAATTGTTAAACC
Capsicum frutescens clone BAC PEPBAC043M10, complete sequence.
FJ597539.1:71364-71384
TCCTACACTAACATATTTTTTCAATCTTTA71364AAAAGGAAGGTTCTCATTGTTGCATTGTTGCATTGTTGCTACTACTGAATT
Capsicum frutescens clone BAC PEPBAC268G7, complete sequence.
FJ597541.1:32987-33007
TCCTACACTAACATATTTTTTCAATCTTTA32987AAAAGGAAGGTTCTCATTGTTGCATTGTTGCATTGTTGCTACTACTGAATT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 11, sequence.
AP026706.1:274567189-274567209
GGTTTAACAATTCAGTAGTAGCAACAATGC274567189AACAATGAGAACCTTCCTTTTTAAAGATTGAAAAAATATGTTAGTGTAGGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAAAGGAAGGTTCTCATTGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAAAGGAAGGTTCTCATTGTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.172 | 0.163 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAAGGAAGGTTCTCATTGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.239 | 0.067 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACAATGAGAACCTTCCTTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.240 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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