GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-02 15:45:32, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Rhagio lineola genome assembly, chromosome: 1.
OZ124298.1:389813499-389813518
CTTAATTCCTTTGCCCCGTTGTTTCAACAA389813499AAACTCTCTGACCTCGGCAATTTTTATATCTCCCACAATGCATTGGTATG
Raphanus sativus mRNA, clone: RSCS05A19, 5' end sequence.
FY447576.1:605-624
TCCAGTGGCCTGACACTTGTGGTATTGAGA605TTGCCGAGGTCAGAGAGTTTGAGCCTAGTGAAGTGGATGAACTGGATGAT
TSA: Raphanus sativus RS10605 mRNA sequence.
JT795152.1:598-617
TCCAGTGGCCTGACACTTGTGGTATTGAGA598TTGCCGAGGTCAGAGAGTTTGAGCCTAGTGAAGTGGATGAACTGGATGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAACTCTCTGACCTCGGCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAACTCTCTGACCTCGGCAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.222 | 0.213 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AAACTCTCTGACCTCGGCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.474 | 0.252 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TTGCCGAGGTCAGAGAGTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.476 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).