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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-03-03 00:34:27, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Prunus armeniaca genome assembly, chromosome: 6.
OZ046365.2:11806988-11807011
TTCTAACGGCCACCGAGATCGCTAGTGGAG11806988AAACTTTGCTTAGCCTTATACTTTATCACAACCAAGCTAAGGCATTGCTTAGCC
Prunus armeniaca genome assembly, chromosome: 6.
OZ177842.1:11371244-11371267
ACGGCCACCGAGAGAAAATACTCGCTAGTG11371244AAACTTTGCTTAGCCTTATACTTTATCACAACCAAGCTAAGGCATTGCTTAGCC
Prunus brigantina genome assembly, chromosome: 6.
OZ184547.1:11682306-11682329
GCCATCGAGATGAAATACCTGCCGGTGGAG11682306AAACTTTGCTTAGCCTTATACTTTACATCGACCAAGTTAAGGCACTACTTGTTG
PP_LEc0013N24f Peach shoot Prunus persica cDNA clone PP_LEc0013N24f, mRNA sequence.
DW347045.1:266-289
CAACATGTAATGCCTTAACTTGGTCGTGGT266AAAGTATAAGGCTAAGCAAAGTTTCTCCATCGGCAAGTATTTCCTCTCGGTGGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAACTTTGCTTAGCCTTATACTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAACTTTGCTTAGCCTTATACTTT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.176 | 0.167 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AAACTTTGCTTAGCCTTATACTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.317 | 0.141 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AAAGTATAAGGCTAAGCAAAGTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.318 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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