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2025-04-03 11:50:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus DNA, clone:LjT53e14_not.
AG261521.1:514-538
AAATACTCAGCTATTTTTTTTTTTTAAAAA514AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATAACTTAATATAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjT38E13, TM0115.
AP004943.1:63306-63330
TTAAATACTCAGCTATTTTTTTTTTAAAAA63306AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATAACTTAATTACT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjB15I15, BM0531.
AP006836.1:8220-8244
TAAATACTCAGCTATTTTTTTTTTTAAAAA8220AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATAACTTAATATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:15732385-15732409
TTAAATACTCAGCTATTTTTTTTAAAAAAA15732385AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATAACTTAATATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:30006978-30007002
CTTAAATACTCAGCTATTTATTTTTTTAAA30006978AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATAACTTAATATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 2, complete sequence.
AP022630.1:95294768-95294792
CTTAAATACTCAGCTATTTTTTATTATAAA95294768AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATAACTTAATATAT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:24979296-24979320
ACCTTAAATAATCACATATTTTTAAAAAAA24979296AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTGAATATTCATTTCAAA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:82826455-82826479
TTAAATACTCAGCTATTTTTTTTTTAAAAA82826455AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGCTTAAGTTAATTTGTTAATAACTTAATTACT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT13A11, TM0224.
AP006379.1:39521-39545
ATATATTAAGTTATTAACAAATTAACTTAA39521GCTATAACTTTCAAACTTACTCTTTTTTATAATAAAAAATAGCTGAGTATTTAAG
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:10548505-10548529
ATATATTAAGTTATTAACAAATTAACTTAA10548505GCTATAACTTTCAAACTTACTCTTTTTTTTAAAAAAAAAAAATAGCTGAGTATTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:4638035-4638059
TAATAATAATATATGAACATATTAACTTAT4638035GCTATAACTTTCAAACTTACTCTTTTTATAAAAAAGGCTAAAAAGCACTTTTGGC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:55148665-55148689
ATATATTAAGTTATTAACAAATTAACTTAA55148665GCTATAACTTTCAAACTTACTCTTTTTTTTTAAAAAAAAATAGCTGAGTATTTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.110 | 0.101 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAGAGTAAGTTTGAAAGTTATAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.145 | 0.035 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTATAACTTTCAAACTTACTCTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=42
0.148 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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