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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:02:51, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Occ.
CP125842.1:7545154-7545172
GGTGTTGAAGGAGCGGGAAGTGGTGGAGGC7545154GACGGGACGGAGAGACTTTGAGAGGAGGTTGGTGGAAGAGAGTAAGCGT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Pall.
CP125843.1:8625596-8625614
GGTGTTGAAGGAGCGGGAGGCGGTGGAGGT8625596GACGGGACGGAGAGACTTTGAGAGGAGGTTGGTGGAAGAGAGAAAGCGC
Micropterix aruncella genome assembly, chromosome: 28.
OX155977.1:10596998-10597016
GGCTGTTACTGACACTGCCCATCCATGGCT10596998GACGGGACGGAGAGACTTTCGCTTTGCTTTCATTTAAAAAAGACGGCCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAAGTCTCTCCGTCCCGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAAGTCTCTCCGTCCCGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.156 | 0.147 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAGTCTCTCCGTCCCGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.229 | 0.074 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACGGGACGGAGAGACTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.233 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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