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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 19:12:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

1443280_5_L22_085 PY06 Carica papaya cDNA, mRNA sequence.
EX262927.1:820-839
GGAGAAAGGAGTGTTTGACTATGAGGCAGG820AAATTGAAAAGTTGGGACGGGTTAAAGGGTTCGAGTGCTTGGGAAAATGT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT09L22, TM0063.
AP004532.1:29948-29967
ATATATCAATCAATTTTTAATATATATCAG29948CCGTCCCAACTTTTCAATTTGGCATTATGGCATTATGCTATCTATTTCCT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:79572838-79572857
ATATATCAATCAATTTTTAATATATATCAG79572838CCGTCCCAACTTTTCAATTTGGCATTATGGCATTATGCTATCTATTTCCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAATTGAAAAGTTGGGACGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAATTGAAAAGTTGGGACGG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.417 | 0.409 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAATTGAAAAGTTGGGACGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.515 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGTCCCAACTTTTCAATTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.516 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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