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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-15 18:49:52, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:44065584-44065603
TTAGATCTTTTTATGAATGACTCATATTAA44065584AACAAATTAATCGTCACAGGATCAATTAAAAAATTCATGGGACTTTTTAT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT15B22, TM0632.
AP010031.1:41891-41910
ATAAAAAGTCCCATGAATTTTTTAATTGAT41891CCTGTGACGATTAATTTGTTTTAATATGAGTCATTCATAAAAAGATCTAA
Calliphora vomitoria genome assembly, chromosome: 1.
OW818029.2:87770485-87770504
AGAAGTTTCCAGGAACTCAAATAGACCAGA87770485CCTGTGACGATTAATTTGTTATTTCATCAGACAAGGATGATACCCAATTG
Plusia festucae genome assembly, chromosome: 9.
OX494439.1:1459151-1459170
AATTACCTACTATAGAAATATTTTATAAAA1459151CCTGTGACGATTAATTTGTTCAGTGGCTGGGTGTAATTTATCTATAATAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACAAATTAATCGTCACAGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACAAATTAATCGTCACAGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.366 | 0.358 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACAAATTAATCGTCACAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.464 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTGTGACGATTAATTTGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.466 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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