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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-05 21:35:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Gouania willdenowi genome assembly, chromosome: 21.
LR132001.1:32929198-32929217
GTTGAATCCAGAGTGACCCTGAGATACTTG32929198AACTCCTCAGCAATGTCAAGCACAAGTGTCTCCAAGGAACCCATTGGACT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjB07M21, BM1485.
AP008108.2:6878-6897
TCCACACTTGATTGGCAACATGAAACTTAA6878AACTCCTCAGCAATGTCAAGTCAAAAAGCCCCCTGATAGTAAACATCATT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:97982265-97982284
TCCACACTTGATTGGCAACATGAAACTTAA97982265AACTCCTCAGCAATGTCAAGTCAAAAAGCCCCCTGATAGTAAACATCATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACTCCTCAGCAATGTCAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACTCCTCAGCAATGTCAAG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.321 | 0.312 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACTCCTCAGCAATGTCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.401 | 0.080 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGACATTGCTGAGGAGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.401 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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