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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:19:11, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Coffea arabica microsatellite DNA, clone ZapII.32.
AJ250258.1:79-98
GCTCTAACTCTACTTATACTCCTCCTTATT79AACTCTCCATTCCCGCATTCCCAGGGCTTCAAAAACACACACTACACACA
Coffea arabica microsatellite DNA, clone 34-2CTG.
AJ308755.1:79-98
GCTCTAACTCTACTTATACTCCTCCTTATT79AACTCTCCATTCCCGCATTCCCAGGGCTTCAAAAACACACACTACACACA
Coffea arabica microsatellite DNA, clone 12-4CTG.
AJ308790.1:126-145
TGTGTGTAGTGTGTGTTTTTNAAGCCCTGG126GAATGCGGGAATGGAGAGTTAATAA
Coffea arabica microsatellite DNA, clone 12-4CTG.
AJ308796.1:126-145
TGTGTGTAGTGTGTGTTTTTGAAGCCCTGG126GAATGCGGGAATGGAGAGTTAATAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACTCTCCATTCCCGCATTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACTCTCCATTCCCGCATTC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.167 | 0.159 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACTCTCCATTCCCGCATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.256 | 0.088 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATGCGGGAATGGAGAGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.257 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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