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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 07:17:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Fistulifera solaris JPCC DA0580 DNA, chromosome 22_h, complete sequence.
AP026156.1:110011-110030
CGGTTCAATTGGTAATATTCCTGGAGTCGG110011AACTGCTGTAGCAGCTATCCCTATGGTTGGTAATGCGATTGTGGGTGAGC
TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig27739.UPAS mRNA sequence.
EZ645456.1:1079-1098
ATGAATGAGAATAAAAGGCGAAGGCTGCAG1079GGATAGCTGCTACAGCAGTTGCAGTTGTGGCTACGGACCTCAGAAATGTC
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig25493.Asha mRNA sequence.
EZ673357.1:1049-1068
ATGAATGAGAATAAAAGGCGAAGGCTGCAG1049GGATAGCTGCTACAGCAGTTGCAGTTGTGGCTACGGACCTCAGAAATGTC
Fistulifera solaris JPCC DA0580 DNA, chromosome 22_h, complete sequence.
AP026156.1:7769-7788
GCTCACCCACAATCGCATTACCAACCATAG7769GGATAGCTGCTACAGCAGTTCCGACTCCAGGAATATTACCAATTGAACCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AACTGCTGTAGCAGCTATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AACTGCTGTAGCAGCTATCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.326 | 0.317 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACTGCTGTAGCAGCTATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.419 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATAGCTGCTACAGCAGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.421 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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