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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:40:02, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Elaeis guineensis isotig13854.Elguifruit mRNA sequence.
JO101081.1:2337-2360
CCTCACATGACAGGTATGGCTATGGTGGTC2337AAGACGATCGACGTGATAGAGGGTCAGGGGGAGGTAGAGCCCAGAGCCGCCGGA
Elaeis guineensis dead-box ATP-dependent RNA helicase (DDX) mRNA, partial cds.
KC146065.1:480-503
CCTCACATGACAGGTATGGCTATGGTGGTC480AAGACGATCGACGTGATAGAGGGTCAGGGGGAGGTAGAGCCCAGAGCCGCCGGA
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig09540.
LM612421.1:815-838
TCCGGCGGCTCTGGGCTCTACCTCCCCCTG815ACCCTCTATCACGTCGATCGTCTTGACCACCATAGCCATACCTGTCATGTGAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGACGATCGACGTGATAGAGGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGACGATCGACGTGATAGAGGGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.141 | 0.133 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGACGATCGACGTGATAGAGGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.278 | 0.136 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCCTCTATCACGTCGATCGTCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.279 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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