GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 15:29:57, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Apodemus sylvaticus genome assembly, chromosome: 6.
OX359303.1:31286812-31286831
CTCACACAGTTTTGGAGAGTAGGAAGGTTC31286812AAGACTGGGAGAGGGACCAGCAGAACTTGTGTTTGGTGAGAACCTGCTTT
Sylvilagus floridanus genome assembly, chromosome: 18.
OX463240.1:13156978-13156997
ACCAGGGCTTTAACCCGCTGTGTGACAGCG13156978CTGGTCCCTCTCCCAGTCTTACCTACTGAGGAAATCAGTGATTTTGAACA
Rhinatrema bivittatum genome assembly, chromosome: 4.
LR584390.1:449665968-449665987
TGTCTGCCAATCTCAAATAACTCAAAGTTT449665968CTGGTCCCTCTCCCAGTCTTGGTGGCACATCAATCGTCTAGAAGCCCGAG
Rhinatrema bivittatum genome assembly, chromosome: 8.
LR584394.1:80597806-80597825
CATCTTCCAATCTCAAACGACTCAAGGTTT80597806CTGGTCCCTCTCCCAGTCTTGGTGGCACATCAATCGTTTAGAAGCCCGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGACTGGGAGAGGGACCAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGACTGGGAGAGGGACCAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.370 | 0.361 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGACTGGGAGAGGGACCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.483 | 0.113 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGGTCCCTCTCCCAGTCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.485 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).