GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:50:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

S.oleracea mRNA for protein kinase.
X73298.1:2218-2240
GACCCTAGAAGCGCCTTTTAAATTGATCGG2218AAGAGATCCAAATGCAAAGGAAGTTAAATGGGATGATGATGGAGTCCTTGCTT
S.oleracea mRNA for protein kinase.
Z30332.1:2103-2125
GACCCTAGAAGCGCCTTTTAAATTGATCGG2103AAGAGATCCAAATGCAAAGGAAGTTAAATGGGATGATGATGGAGTCCTTGCTT
Caprimulgus europaeus genome assembly, chromosome: 10.
OU015533.1:25272259-25272281
CTGTATTGTAGGATTTTGTTGCAGGAATCT25272259CTTCCTTTGCATTTGGATCTCTTGTCTCTTTATATTCAATCAATTTACTTAGA
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:189719508-189719530
AAGCAAGGACTCCATCATCATCCCATTTAA189719508CTTCCTTTGCATTTGGATCTCTTCCGATCAATTTAAAAGGCGCTTCTAGGGTC
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:192742786-192742808
AAGCAAGGACTCCATCATCATCCCATTTAA192742786CTTCCTTTGCATTTGGATCTCTTCCGATCAATTTAAAAGGCGCTTCTAGGGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGAGATCCAAATGCAAAGGAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGAGATCCAAATGCAAAGGAAG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.113 | 0.105 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGAGATCCAAATGCAAAGGAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.161 | 0.048 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTCCTTTGCATTTGGATCTCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.163 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).