GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 13:37:40, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GQ0081.BR_C23 GQ008: Cambium, phloem and bark of girdled saplings Picea glauca cDNA clone GQ0081_C23 5', mRNA sequence.
CK434295.2:658-677
GCCTCGGAGCAGGGAAGTCACCTCCAGGTA658TAAGACTGCCACTACATCTTCTTCTGGGCCTCCGACGACTTCTGCCAGAC
GQ0081.BR.1_C23 GQ008: Cambium, phloem and bark of girdled saplings Picea glauca cDNA clone GQ0081_C23 5', mRNA sequence.
CO472716.2:659-678
GCCTCGGAGCAGGGAAGTCACCTCCAGGTA659TAAGACTGCCACTACATCTTCTTCTGGGCCTCCGACGACTTCTGCCAGAC
TSA: Larix kaempferi PEMC20924.Lakaproemb mRNA sequence.
JR151243.1:380-399
GCCTCGGAGCAGGGAAGTCACATCCAGGTA380TAAGACTGCCACTACATCTTCTTCTGTGCCTCCGACGACTTCTGCCAGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGATGTAGTGGCAGTCTTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGATGTAGTGGCAGTCTTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.195 | 0.186 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGATGTAGTGGCAGTCTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.349 | 0.154 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAAGACTGCCACTACATCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.351 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).