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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 15:00:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Pipistrellus nathusii genome assembly, chromosome: 2.
OY882859.1:669244-669263
CCTACTGAGTGCTGAGAAGCACGTAGGCTA669244AAGGGGTGCATTAACCAGGCGAGAACACTGTGGCCAGGAAGCTGGGGGCC
Pipistrellus nathusii genome assembly, chromosome: 2.
OY883179.1:668434-668453
CCTACTGAGTGCTGAGAAGCACGTAGGCTA668434AAGGGGTGCATTAACCAGGCGAGAACACTGTGGCCAGGAAGCTGGGGGCC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 3, complete sequence.
AP022631.1:20205035-20205054
ATAGTATTGTATCAGTACCCTACCTATTTT20205035AAGGGGTGCATTAACCAGGCCGTAAATGAATTAGCTACTTTTTAAAACTT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 3, clone: LjB23H05, BM1543.
AP009946.1:14382-14401
AAGTTTTAAAAAGTAGCTAATTCATTTACG14382GCCTGGTTAATGCACCCCTTAAAATAGGTAGGGTACTGATACAATACTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGGGGTGCATTAACCAGGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGGGGTGCATTAACCAGGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.156 | 0.147 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGGGTGCATTAACCAGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.208 | 0.052 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCCTGGTTAATGCACCCCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.208 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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