GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-07 04:46:06, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Hyphobacterium sp. isolate 9cf7ff88-0c28-40ca-a9a8-8005ab687421 genome assembly, chromosome: 1.
OZ245930.1:877740-877758
GGGAAATAGTGGCGCCAGCAAGGGCGCCCA877740AAGTCATTCCGCCGGCAATCCATGGCAGAGGCCAACCGGTGGATTCGCT
Dichetophora obliterata genome assembly, chromosome: 1.
OY986435.1:124163191-124163209
TTGTCCTACTACCTTACGATTAATGGAGAC124163191ATTGCCGGCGGAATGACTTAACGAAAGACTTAACGAAGAATGATTTTTG
Polychrysia moneta genome assembly, chromosome: 27.
OZ194675.1:8313672-8313690
CTCCGATAACAATATAATAAAACGGTTTAT8313672ATTGCCGGCGGAATGACTTTGACGTTTATTTACTTTCTTACAAGGATAA
Andrena barbilabris genome assembly, chromosome: 2.
OZ242045.1:23099822-23099840
GATGAAGGACTAGATGCGGTCACGCCTCTT23099822ATTGCCGGCGGAATGACTTCAAGATCATTATGTAACTATCTTGAACGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGTCATTCCGCCGGCAAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGTCATTCCGCCGGCAAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.500 | 0.490 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=AAGTCATTCCGCCGGCAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.789 | 0.290 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ATTGCCGGCGGAATGACTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.791 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).