GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-04 22:24:29, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A02.
CP030984.1:72010104-72010123
CCGTATCTAGTTGAGGCCGGATTCGGCGAC72010104ATAGTGCCCCTCAGGGACTTCACTTTTGACAATTCCCTAATCTCAGCACT
Arachis hypogaea cultivar Yunnan Rainbow Peanut chromosome 02.
CP156089.1:75817805-75817824
CCGTATCTAGTTGAGGCCGGATTCGGCGAC75817805ATAGTGCCCCTCAGGGACTTCACTTTTGACAATTCCCTAATCTCAGCACT
Arachis hypogaea cultivar Huayu23 chromosome 02.
CP156109.1:75593626-75593645
CCGTATCTAGTTGAGGCCGGATTCGGCGAC75593626ATAGTGCCCCTCAGGGACTTCACTTTTGACAATTCCCTAATCTCAGCACT
Arachis hypogaea cultivar Chedouzi chromosome 02.
CP156129.1:75480094-75480113
CCGTATCTAGTTGAGGCCGGATTCGGCGAC75480094ATAGTGCCCCTCAGGGACTTCACTTTTGACAATTCCCTAATCTCAGCACT
Arachis hypogaea cultivar Laiyang Silihong chromosome 02.
CP156149.1:75048952-75048971
CCGTATCTAGTTGAGGCCGGATTCGGCGAC75048952ATAGTGCCCCTCAGGGACTTCACTTTTGACAATTCCCTAATCTCAGCACT
Arachis duranensis isolate Y26 chromosome 02.
CP160341.1:87488980-87488999
CCGTATCTAGTTGAGGCCGGATTCGCCGAC87488980ATAGTGCCCCTCAGGGACTTCACTTTTGACAATTCCCTAATCTCAGCACT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGTCCCTGAGGGGCACTAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGTCCCTGAGGGGCACTAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.215 | 0.206 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=AAGTCCCTGAGGGGCACTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.367 | 0.153 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ATAGTGCCCCTCAGGGACTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.372 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).