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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:01:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 1.
CP126370.1:15456452-15456471
TAAGTACCTGAAATAACTCTGAGGAATCTG15456452AATCCGTCACGTCAAGTTCCACAACTGCTCAGCAACCCATAATTCTAAGA
Musa acuminata subsp. malaccensis isolate AA chromosome 12.
CP126381.1:15664413-15664432
TAAGCACCTGAAATAACTCTGAGGAATCTG15664413AATCCGTCACGTCAAGTTCCACAACTGCTCAGCAACCCATAATTCTAAGA
Musa acuminata subsp. malaccensis strain Doubled-haploid Pahang (DH-Pahang) genome assembly, chromosome: A01.
HG996466.1:7645624-7645643
TAAGCACCTGAAATAACTCTGAGGAATCTG7645624AATCCGTCACGTCAAGTTCCACAACTGCTCAGCAACCCATAATTCTAAGA
Halorarius halobius strain ZY10 plasmid unnamed1, complete sequence.
CP101162.1:93097-93116
TTCCGATCCGGGTGCCGTCGCAGTTGACTG93097GGAACTTGACGTGACGGATTCCCTTCTCTTACAGATCCTCGCGTACGTGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AATCCGTCACGTCAAGTTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATCCGTCACGTCAAGTTCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.159 | 0.150 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATCCGTCACGTCAAGTTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.239 | 0.080 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAACTTGACGTGACGGATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.240 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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