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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 18:49:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Populus trichocarpa calcineurin B-like protein 1 (CBL1) gene, complete cds.
EF148841.1:5053-5075
TTCTCTTTTGTTTGAATGTGGCTATTACTA5053AATCTGGTGTCCATGTAACCATGAGAAATTCATGCAAATATTATGGCCAGAAA
Populus nigra genome assembly, chromosome: 8.
OX637679.1:11272957-11272979
TTCTCTTTTGTTTGAATGCGGCTATTACTA11272957AATCTGGTGTCCATGTAACCATGAGAAATTCATGCAAATATTATGACAAGAAT
WS01915.B21_E07 PT-DX-N-A-10 Populus trichocarpa cDNA clone WS01915_E07 3', mRNA sequence.
CV230049.1:151-173
TTTCTGGCCATAATATTTGCATGAATGTCT151CATGGTTACATGGACACCAGATTTAGTAATAGCCACATTCAAACAAAAGAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AATCTGGTGTCCATGTAACCATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATCTGGTGTCCATGTAACCATG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.176 | 0.168 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATCTGGTGTCCATGTAACCATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.314 | 0.137 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CATGGTTACATGGACACCAGATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.315 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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