GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-04 23:35:06, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.20.C1.
FX296508.1:60-79
CTTGCTTCTCAACCTTCCTTCACTTCGCAA60AATGCAAGCCTACCCACAACGCTCCTGCCAAACCGCCTACGCCTCTGGCG
TSA: Dianthus caryophyllus mRNA, contig: CAK09.22881.C1.
FX327267.1:71-90
CTTGCTTCTCAACCTTCCTTCACTTCGCAA71AATGCAAGCCTACCCACAACGCTCCTGCCAAACCGCCTACGCCTCTGGCG
Persicaria nepalensis genome assembly, chromosome: 12.
OZ284459.1:13082898-13082917
GAGCTATAGATAAGATAACTTGTACTCGTA13082898AATGCAAGCCTACCCACAACGCCCATAGGACAAAGAAACAGAAACAAAGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AATGCAAGCCTACCCACAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGCAAGCCTACCCACAAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.239 | 0.230 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=AATGCAAGCCTACCCACAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.373 | 0.134 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GTTGTGGGTAGGCTTGCATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.373 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).