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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:21:46, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

OPR02973 Elaeis guineensis root Elaeis guineensis cDNA clone OPVRXX_A2038.seq, mRNA sequence.
EL692931.1:156-182
AGCTGCGAGGATTGAAGGGGTTTTCAATGA156AATGTTCCTGCACTTGTTCTTATCTGGATTTATCATAGTCAACTGCTTGCCTATCTA
TSA: Elaeis guineensis isotig01618.Elguifruit mRNA sequence.
JO088871.1:1959-1985
AGCTGCGAGGATTGAAGGGGTTTTCAATGA1959AATGTTCCTGCACTTGTTCTTATCTGGATTTATCATAGTCAACTGCTTGCCTATCTA
Elaeis guineensis clone estEgSNP2 cellulose synthase-like protein CslG (CslG) mRNA, partial cds.
JX438708.1:1960-1986
AGCTGCGAGGATTGAAGGGGTTTTCAATGA1960AATGTTCCTGCACTTGTTCTTATCTGGATTTATCATAGTCAACTGCTTGCCTATCTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AATGTTCCTGCACTTGTTCTTATCTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTCCTGCACTTGTTCTTATCTGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.322 | 0.314 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AATGTTCCTGCACTTGTTCTTATCTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.403 | 0.081 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAGATAAGAACAAGTGCAGGAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.403 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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