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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-08 07:43:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjB03D07, BM1847b.
AP010395.1:11212-11231
AGGAAACATGCGACCCTGCAACAACATGCG11212ACAACACCTGGAGCACATCGTTGCTCCTTCGCCGCCACCACCACCACCAC
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT46E22, TM0849.
AP007635.2:86190-86209
GTGGTGGTGGTGGTGGCGGCGAAGGAGCAA86190CGATGTGCTCCAGGTGTTGTCGCATGTTGTTGCAGGGTCGCATGTTTCCT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:55572432-55572451
GTGGTGGTGGTGGTGGCGGCGAAGGAGCAA55572432CGATGTGCTCCAGGTGTTGTCGCATGTTGTTGCAGGGTCGCATGTTTCCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACAACACCTGGAGCACATCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACAACACCTGGAGCACATCG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.360 | 0.351 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACAACACCTGGAGCACATCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.454 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGATGTGCTCCAGGTGTTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.456 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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