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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-15 17:17:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sequence 72270 from Patent EP2761003.
JC686489.1:364-383
ACACACACACAAATGGAAGTATCAGTTGTG364GCCAGTGTTGCACTACGTGTTTTTTGGGTGAGCATAGTAATTAC
UDP96-003 AC- and AG-enriched peach leaf genomic libraries Prunus persica STS genomic clone peach-ac 4, sequence tagged site.
BV079690.1:152-171
ACACACACACAAATGGAAGTATCAGTTGTG152GCCAGTGTTGCACTACGTGTTTTTTTGGGTGAGCATAGT
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd04.
AP019300.1:8904361-8904380
ACACACACACAAATGGAAGTATCAGTTGTG8904361GCCAGTGTTGCACTACGTGTTTTTTGGATGAGTATAGTAATTACATGGGC
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd04.
AP019300.1:9010108-9010127
ACACACACACAAATGGAAGTCTCAGTTGCG9010108GCCAGTGTTGCACTACGTGTTGTTTGGGTGAGCGTAATAATTACATCGGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACACGTAGTGCAACACTGGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACACGTAGTGCAACACTGGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.114 | 0.105 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACACGTAGTGCAACACTGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.172 | 0.058 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCCAGTGTTGCACTACGTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.175 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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