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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:11:19, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig38587 mRNA sequence.
JW088831.1:1138-1161
TGAATGCGCCTCAAATGTTCAGTGATGAAA1138ATCCCAACGGTTGTTTGATCATGTAAAATGATCACCATTGACCAATGTTTCTGA
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:182108076-182108099
TGAATGCGCCTCAAATGTTCAGTGATGAAA182108076ATCCCAACGGTTGTTTGATCATGTAAAATGATCACCATTGACCAATGTTTCTGA
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:188253828-188253851
TGAATGCGCCTCAAATGTTCAGTGATGAAA188253828ATCCCAACGGTTGTTTGATCATGTAAAATGATCACCATTGACCAATGTTTCTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACATGATCAAACAACCGTTGGGAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACATGATCAAACAACCGTTGGGAT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.344 | 0.335 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACATGATCAAACAACCGTTGGGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.453 | 0.109 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCCCAACGGTTGTTTGATCATGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.456 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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