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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 19:19:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjB18O02, BM1592.
AP008171.2:35956-35975
AATATTTCCTCTGTATACTTGAAAGAATAA35956ACATTCAAAGGTATGGCAGGGTCTTTCTCAAGTGCAACCTTTGTTTTTTT
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 5, complete sequence.
AP022633.1:51176-51195
AATATTTCCTCTGTATACTTGAAAGAATAA51176ACATTCAAAGGTATGGCAGGGTCTTTCTCAAGTGCAACCTTTGTTTTTTT
Borostomias antarcticus genome assembly, chromosome: 1.
OX465204.1:17797667-17797686
TCACTTTCTAAGACTGTAGAGGTAATTTGA17797667CCTGCCATACCTTTGAATGTATAGGGCACCCATATTGGGACAGGCCTCCT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT48J22, TM0335b.
AP006350.1:65730-65749
AAAAAAACAAAGGTTGCACTTGAGAAAGAC65730CCTGCCATACCTTTGAATGTTTATTCTTTCAAGTATACAGAGGAAATATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACATTCAAAGGTATGGCAGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACATTCAAAGGTATGGCAGG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.321 | 0.313 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACATTCAAAGGTATGGCAGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.438 | 0.117 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCTGCCATACCTTTGAATGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.439 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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