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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:24:42, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Thalassophryne amazonica genome assembly, chromosome: 6.
LR722971.1:106462831-106462850
GAAAAGCACATCATCCTGAGTACTAATGTT106462831GAGTGAGGATGCAAGAATGTGGCCTGGCTTGCCCAGGTAGGCAGCCTGCA
Pyrus communis genome assembly, chromosome: 2.
OY757069.1:1676597-1676616
TGCGGAGGAAGAGACAGAAATTCAGAAAGG1676597GAGTGAGGATGCAAGAATGTGATCATGTGGGGAGTCTTTGAGAAATTTCT
Plagodis dolabraria genome assembly, chromosome: 4.
OY978444.1:23159750-23159769
TATATTTCAATTATAAATGCGAATGTTTCT23159750GAGTGAGGATGCAAGAATGTGCGTATATTTGTTTCAATTTCACTATGAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACATTCTTGCATCCTCACTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACATTCTTGCATCCTCACTC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.168 | 0.160 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACATTCTTGCATCCTCACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.269 | 0.101 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTGAGGATGCAAGAATGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.271 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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