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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 17:07:27, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

VCDC9569 Daucus carota subsp. sativus B493_1-2kb Daucus carota subsp. sativus cDNA clone CAR02_021_A08 5', mRNA sequence.
JG761887.1:589-608
CTTTGTGTCAAGAATATCGTGAGCTCAAGA589ACCAAGGCTTTGAACTGTCCATAGGATGGCATGGAAATGCGGAGAACATA
VCDC9837 Daucus carota subsp. sativus B493_1-2kb Daucus carota subsp. sativus cDNA clone CAR02_021_M24 5', mRNA sequence.
JG762155.1:589-608
CTTTGTGTCAAGAATATCGTGAGCTCAAGA589ACCAAGGCTTTGAACTGTCCATAGGATGGCATGGAAATGCGGAGAAACAT
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 2.
CP093344.1:48704387-48704406
CTTTGTGTCAAGAATATCGTGAGCTCAAGA48704387ACCAAGGCTTTGAACTGTCCATAGGTAAGCACACTCACTTCCTTTACCAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCAAGGCTTTGAACTGTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCAAGGCTTTGAACTGTCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.730 | 0.721 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCAAGGCTTTGAACTGTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.843 | 0.112 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGACAGTTCAAAGCCTTGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.843 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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