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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:47:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lutra lutra genome assembly, chromosome: 7.
LR738409.1:3164726-3164745
TTCAGGAGCTCCGTTTACACAATCTCTCCC3164726ACCATAAGCACCACCTCTGGGTTTTCATACTTTCTTTTCTTTAAAGTAAT
AdH1188-CPY2-A22TR AdH1 Arachis duranensis genomic clone AdH1188-CPY2-A22, genomic survey sequence.
FI316094.1:473-492
GAATTTATGGTGAGTTAATCGTGCCTAGCT473ACCATAAGCACCACCTCTGGACCTTATCTGCTCTGTAACAACCCTATGGT
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A01.
CP030983.1:85698168-85698187
GAATTTATGGTGAGTTAATCGTGCCTAGCT85698168ACCATAAGCACCACCTCTGGACCTTATCTGCTCTGTAACAACCCTATGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCATAAGCACCACCTCTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCATAAGCACCACCTCTGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.199 | 0.190 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCATAAGCACCACCTCTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.305 | 0.106 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAGAGGTGGTGCTTATGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.305 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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