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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 12:26:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Pleuronectes platessa genome assembly, chromosome: 3.
OX374650.1:26241060-26241079
AGCACCACTGACCTTCTCGAACAATACTCT26241060ACCATGCCTCCATCACTACTCGCTCCAGTGGGATCTCTTCCTACAACAAC
Platycnemis pennipes genome assembly, chromosome: 10.
OW121856.1:40313424-40313443
CCGTGTTCCCCCCTCTGCTGTTACCATGCG40313424ACCATGCCTCCATCACTACTCCTCCGCCCCACCCACGGGGGAAACTCGGG
TSA: Cannabis sativa PK04793.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449783.1:2251-2270
ATCATCAAGCTCAAGTGAATGTTGTGATGC2251AGTAGTGATGGAGGCATGGTTTGAGCCATCAAATGGTGAACTCATTGTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCATGCCTCCATCACTACT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCATGCCTCCATCACTACT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.180 | 0.172 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCATGCCTCCATCACTACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.277 | 0.097 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTAGTGATGGAGGCATGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.278 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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