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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-02-23 04:11:04, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 5.
CP158654.1:267964-267983
TGACAATGAGTTCACCATTTGATGGCTCAA267964ACCATGCCTCCATCACTACTGCATCACAACATTCACTTGAGCTTGATGAT
Symbiodinium pilosum genome assembly, chromosome: 7.
OZ125744.1:3866069-3866088
TGGGTTCTTGGAATATTAATACTTTACAGA3866069ACCATGCCTCCATCACTACTAACCACGAGTCAGACCAGGAAATGCAGCAG
Platycnemis pennipes genome assembly, chromosome: 10.
OW121856.1:40313424-40313443
CCGTGTTCCCCCCTCTGCTGTTACCATGCG40313424ACCATGCCTCCATCACTACTCCTCCGCCCCACCCACGGGGGAAACTCGGG
Pleuronectes platessa genome assembly, chromosome: 3.
OX374650.1:26241060-26241079
AGCACCACTGACCTTCTCGAACAATACTCT26241060ACCATGCCTCCATCACTACTCGCTCCAGTGGGATCTCTTCCTACAACAAC
TSA: Cannabis sativa PK04793.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449783.1:2251-2270
ATCATCAAGCTCAAGTGAATGTTGTGATGC2251AGTAGTGATGGAGGCATGGTTTGAGCCATCAAATGGTGAACTCATTGTCA
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 5.
CP158644.1:78039636-78039655
ATCATCATCAAGCTCAAGTGAATGTTGTGC78039636AGTAGTGATGGAGGCATGGTTTGAGCCATCAAATGGTGAACTCATTGTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCATGCCTCCATCACTACT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCATGCCTCCATCACTACT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.112 | 0.103 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=ACCATGCCTCCATCACTACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.159 | 0.047 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AGTAGTGATGGAGGCATGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.160 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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