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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:28:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Musa acuminata AAA Group Unigene20427_B1 mRNA sequence.
JV330325.1:849-868
TACAGAACCTACTCAGATCGATGCCCCAAC849ACCTGATCCAGTGTCAAGGCCGACGTACCTGAATCCAAGCTCTGATGCTA
TSA: Musa acuminata AAA Group Unigene93806_NK1 mRNA sequence.
JV426783.1:504-523
TACAGAACCTACTCAGATCGATGCCCCAAC504ACCTGATCCAGTGTCAAGGCCGACGTACCTGAATCCAAGCTCTGATGCTA
Ricordea florida genome assembly, chromosome: 16.
OX453287.1:1430798-1430817
GGTCACAAAATTGTCCTTATTTCATGGAAC1430798ACCTGATCCAGTGTCAAGGCCACGACAAAGTCAGAATTGTATTGCGGGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCTGATCCAGTGTCAAGGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCTGATCCAGTGTCAAGGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.193 | 0.185 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCTGATCCAGTGTCAAGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.289 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCCTTGACACTGGATCAGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.289 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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