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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-06 12:27:26, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Pisum sativum genome assembly, chromosome: 3.
OZ173752.1:354818889-354818908
AGCTAACGCACAAAGATACCTCATGGTAGT354818889ACCTTGCGATATAATTGATGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATG
Lampides boeticus genome assembly, chromosome: 16.
OZ209388.1:11096975-11096994
ACGTCCCGGAAAATTCATAAATAATTTCAC11096975ACCTTGCGATATAATTGATGTACCCTTTTTCGCTTTCAGATTGGGATTTG
Eudonia mercurella genome assembly, chromosome: Z.
OY720022.2:27339950-27339969
GAGTTTGTGAATGCCACAGACCTCATAGTC27339950CATCAATTATATCGCAAGGTATTGAAAGAGGTCAGTTCCCCATCGTGGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACCTTGCGATATAATTGATG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACCTTGCGATATAATTGATG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.264 | 0.255 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ACCTTGCGATATAATTGATG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.511 | 0.247 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CATCAATTATATCGCAAGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.512 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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