GGGenome | Results

2025-04-15 17:17:15, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

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Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA157ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA122ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 1.
CP141910.1:42505618-42505639

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA42505618ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 1.
CP141927.1:31997894-31997915

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA31997894ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTTAACA

Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141953.1:30247083-30247104

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA30247083ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 1.
CP141970.1:32016230-32016251

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA32016230ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 1.
CP143358.1:31627364-31627385

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA31627364ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 1.
CP143375.1:30021939-30021960

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA30021939ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 1.
OU696503.1:28466407-28466428

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA28466407ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU696677.1:28451466-28451487

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA28451466ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744542.1:32191086-32191107

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA32191086ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744953.1:31787488-31787509

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA31787488ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

Malus domestica genome assembly, chromosome: 1.
OU744991.1:28703084-28703105

GTACTTTTCATTCGCGAAAGGGTTACAGAA28703084ACCTTTATGACGGATGTGGTTCTTAAGATCCTAAACACAGGAAGTTTAACAA

010421AASA005600HT (AASA) Royal Gala 10 DAFB fruit Malus domestica cDNA clone AASA005600, mRNA sequence.
CN879102.1:285-306

TTGTTAAACTTCCTGTGTTTAGGATCTTAA285GAACCACATCCGTCATAAAGGTTTCTGTAACCCTTTCGCGAATGAAAAGTAC

Mdfrt3093m22.y2 Mdfrt Malus domestica cDNA clone Mdfrt3093m22 5', mRNA sequence.
CV466577.1:218-239

TTGTTAAACTTCCTGTGTTTAGGATCTTAA218GAACCACATCCGTCATAAAGGTTTCTGTAACCCTTTCGCGAATGAAAAGTAC

Mdfrt3118g11.y1 Mdfrt Malus domestica cDNA clone Mdfrt3118g11 5' similar to TR:Q9SV27 Q9SV27 HYPOTHETICAL 262.6 KD PROTEIN, mRNA sequence.
CV794459.1:573-594

TTGTTAAACTTCCTGTGTTTAGGATCTTAA573GAACCACATCCGTCATAAAGGTTTCTGTAACCCTTTCGCGA

fl_03C10_AD11 Md_fruit-leaf_subtractive_cDNA_library Malus domestica cDNA, mRNA sequence.
GD254882.1:45-66

TTGTTAAACTTCCTGTGTTTAGGATCTTAA45GAACCACATCCGTCATAAAGGTTTCTGTAACCCTTTCGCGAATGAAAAGT

TTGTTAAACTTCCTGTGTTTAGGATCTTAA442GAACCACATCCGTCATAAAGGTTTCTGTAACCCTTTCGCGAATGAAAAGTAC

Malus x robusta genome assembly, chromosome: 12.
OY720336.1:1730544-1730565

TTGTTAAACTTCCTGTGTTTAGGATCTTAA1730544GAACCACATCCGTCATAAAGGTTTCTGTAACCCTTTCGCGAATGAAAAGTAC

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.524 | 0.514 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCTTTATGACGGATGTGGTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.847 | 0.323 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAACCACATCCGTCATAAAGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=37
0.851 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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