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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:06:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

EG-S41_008_C06 suspSSHS4, initiation library (embryogenic suspension cells cultivated in medium without 2,4-D for 16 days) Elaeis guineensis cDNA clone EG-S41_008_C06 5', mRNA sequence.
GH637515.1:130-153
CTGGAGGAAGGTCTCTGTGATCAATGTTGT130GGTGCTGATCGTTCTTGTGATCGTATACGTTGTTGGGTGTGCCGCATTCAGGAA
TSA: Elaeis guineensis isotig11618.Elguifruit mRNA sequence.
JO098845.1:759-782
CTGGAGGAAGGTCTCTGTGATCAATGTTGT759GGTGCTGATCGTTCTTGTGATCGTATACGTTGTTGGGTGTGCCGCATTCAGGAA
Elaeis guineensis senescence-associated protein (SAG) mRNA, complete cds.
KC146068.1:851-874
CTGGAGGAAGGTCTCTGTGATCAATGTTGT851GGTGCTGATCGTTCTTGTGATCGTATACGTTGTTGGGTGTGCCGCATTCAGGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACGATCACAAGAACGATCAGCACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACGATCACAAGAACGATCAGCACC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.106 | 0.098 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACGATCACAAGAACGATCAGCACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.226 | 0.119 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGCTGATCGTTCTTGTGATCGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.228 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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