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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 20:59:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Raphanus sativus mRNA, clone: RSCF11L22, 5' end sequence.
FY430805.1:693-712
ATGATATCGAGTATATGTTAATTATTTCTC693ACGCACTGAAAAAGAGATCGTTGTCTAGTTTGGTACCAAATTGACACAGC
RR4AA43TF RR4(PB) Raphanus raphanistrum subsp. landra cDNA 5', mRNA sequence.
EV566355.1:52-71
GCTGTGTCAATTTGGTACCAAACTAGACAA52CGATCTCTTTTTCAGTGCGTGAGAAATAATTAACATATACTCGATATCAT
Raphanus sativus mRNA, clone: RSCS05N18, 5' end sequence.
FY447859.1:606-625
GCTGTGTCAATTTGGTACCAAACTAGACAA606CGATCTCTTTTTCAGTGCGTGAGAAATAATTAACATATACTCGATATCAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACGCACTGAAAAAGAGATCG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACGCACTGAAAAAGAGATCG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.273 | 0.264 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACGCACTGAAAAAGAGATCG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.580 | 0.307 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGATCTCTTTTTCAGTGCGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.581 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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