GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-02-24 14:07:39, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK03010.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449166.1:43-62
ACTTCGACTCACTTTTTCTTCTAAAGAAGA43ACGCTGACTCACTTTCCTTCTGCAGTTCCTCTCTCACTCACTCTCTCAGT
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 3.
CP158646.1:11799940-11799959
ACTTTGACTCACTTTTTCTTGTAAAGAAGA11799940ACGCTGACTCACTTTCCTTCTTAGTTCCTCTCTCACTCACTCTCTCAGTC
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome 3.
CP158656.1:12867511-12867530
ACTTTGACTCACTTTTTCTTGTAAAGAAGA12867511ACGCTGACTCACTTTCCTTCTTAGTTCCTCTCTCACTCACTCTCTCAGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACGCTGACTCACTTTCCTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACGCTGACTCACTTTCCTTC | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
0.132 | 0.122 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=ACGCTGACTCACTTTCCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.165 | 0.033 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GAAGGAAAGTGAGTCAGCGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.165 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).