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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 11:40:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Caldilineaceae bacterium isolate cb27a3f3-5ea9-4825-a433-acfe24f43893 genome assembly, chromosome: 1.
OY759723.1:2027027-2027046
CCGTGCGCAGATGTACGGCCAACTTGCACA2027027ACGGTTTAGTGAAACGCAGCGGTCGCCGTTCGATTTCGTAATCGTAGACG
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS47J21.
DH961655.1:202-221
AGATTTTTGTCAATATATTTCACCCGTATA202ACGGTTTAGTGAAACGCAGCGTTTAGACACTTTACCGATAGAAATTTTCG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A02.
CP030984.1:93454038-93454057
CGAAAATTTCTATCGGTAAAGTGTCTAAAC93454038GCTGCGTTTCACTAAACCGTTATACGGGTGAAATATATTGACAAAAATCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACGGTTTAGTGAAACGCAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACGGTTTAGTGAAACGCAGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.192 | 0.183 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACGGTTTAGTGAAACGCAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.277 | 0.085 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTGCGTTTCACTAAACCGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.277 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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