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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:20:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig25119.
LM616482.1:106-129
TCAAGAGCTACATGAAATGAAAAACAACAT106ACTCCTAGCTTCTAAACTCACACATGATAACAGGAAAACCTGGTGGGATGGTGG
TSA: Elaeis guineensis isotig01883.Elguifruit mRNA sequence.
JO089136.1:104-127
TCAAGAGCTACATGAAATGAAAAACAACAT104ACTCCTAGCTTCTAAACTCACACATGATAACAGGAAAACCTGGTGGGATGGTGG
TSA: Elaeis guineensis isotig01884.Elguifruit mRNA sequence.
JO089137.1:104-127
TCAAGAGCTACATGAAATGAAAAACAACAT104ACTCCTAGCTTCTAAACTCACACATGATAACAGGAAAACCTGGTGGGATGGTGG
Elaeis guineensis putative AT-hook DNA-binding protein (AHP1) mRNA, complete cds.
KC146053.1:1624-1647
CCACCATCCCACCAGGTTTTCCTGTTATCA1624TGTGTGAGTTTAGAAGCTAGGAGTATGTTGTTTTTCATTTCATGTAGCTCTTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACTCCTAGCTTCTAAACTCACACA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACTCCTAGCTTCTAAACTCACACA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.307 | 0.299 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTCCTAGCTTCTAAACTCACACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.414 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTGTGAGTTTAGAAGCTAGGAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.415 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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