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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 18:08:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Populus tomentosa clone Potom.001G03353 DUF566 protein mRNA, complete cds.
KT374076.1:49-73
CAAGCAGCAGCAGCAGCAGCTACTAGTTCA49ACTGACAAAACCCCTAATCTAACAAGACCCCCACTTTTACCTTCAGGGAAAGACC
Populus nigra genome assembly, chromosome: 1.
OX637672.1:19808590-19808614
GCAGCAGCAGCAACAGCAGCTACTAGTTCA19808590ACTGACAAAACCCCTAATCTAACAAGACCCCCACTTTTACCTTCAGGGAAAGACC
Populus nigra genome assembly, chromosome: 19.
OX637690.1:8994054-8994078
GGTCTTTCTCTGAAGGTAAAAGTGGGGGTC8994054TTGTTAGATTAGGGGTTTTGTCAGTTGAACTAGCTGCTGCTGCTGCTGTTTGAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACTGACAAAACCCCTAATCTAACAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACTGACAAAACCCCTAATCTAACAA | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.105 | 0.097 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTGACAAAACCCCTAATCTAACAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.132 | 0.027 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGTTAGATTAGGGGTTTTGTCAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.133 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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