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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-05 09:26:13, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Pyrus pyrifolia mRNA, contig: contig_34581.
FX433855.1:9-28
GATTCTTG9ACTGCTTGTAACACCCAACGCAGCCTCTCTCTCTCTCTCAACTCCCAACT
TSA: Pyrus x bretschneideri Unigene1455_XinShao mRNA sequence.
JR596824.1:33-52
TTTAACATTCCGATCGTTCTCTCATTCTTT33ACTGCTTGTAACACCCAACGCAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCAACTCCCAA
Pyrus pyrifolia microsatellite TXY121 sequence.
KC770041.1:72-91
TTTAACATTCCGATCGTTCTCTCATTCTTT72ACTGCTTGTAACACCCAACGCAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCAACTCCCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ACTGCTTGTAACACCCAACG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ACTGCTTGTAACACCCAACG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.373 | 0.365 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTGCTTGTAACACCCAACG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.484 | 0.111 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CGTTGGGTGTTACAAGCAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.484 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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