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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 12:32:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Eptesicus nilssonii genome assembly, chromosome: 8.
OX621287.1:93688003-93688022
CAATCTAAATCAATGCTTTCATCTAGTATG93688003CAATCCAACCTGCTCTTTCTTTCAGATCAGATCAATTTTTAACAAGCCAA
Plecotus auritus genome assembly, chromosome: 3.
OY734024.1:100064502-100064521
CAATCTAAATAAATATTTTCATCTAGTATG100064502CAATCCAACCTGCTCTTTCTTTCAGATCAGATCAATTTTTAGACAAGCCA
TSA: Cannabis sativa PK15500.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP450059.1:357-376
TTTCTATGAGACTATCCGATGCCGCTTTGC357CAATCCAACCTGCTCTTTCTCCTACTGATCATGGCTCTGATTACCGACCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGAAAGAGCAGGTTGGATTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGAAAGAGCAGGTTGGATTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.309 | 0.300 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGAAAGAGCAGGTTGGATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.425 | 0.116 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATCCAACCTGCTCTTTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.427 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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