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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:02:50, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Rhinatrema bivittatum genome assembly, chromosome: 4.
LR584390.1:408816293-408816312
ATGCTTGCCCCCCATCTGCTGGAGACTAGG408816293AGAACAGACATACCACTTCAGTTCCTGAGGTGACATCCGTTCGGTCCCTC
RTFE1_21_A05.g1_A029 Roots minus iron Pinus taeda cDNA clone RTFE1_21_A05_A029 5', mRNA sequence.
DR162864.1:65-84
GCAGTGTAATTACATATATCTTAAGCAGAG65AGAACAGACATACCACTTCAAGTGGATAATCTACAATAACCTACACCTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGAACAGACATACCACTTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGAACAGACATACCACTTCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.217 | 0.209 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGAACAGACATACCACTTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.305 | 0.087 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAAGTGGTATGTCTGTTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.305 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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