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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-03-03 00:55:06, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome X.
CP158662.1:29142140-29142161
GAAAATTCCTAATAATAATAGTGTTGATTT29142140AGACAAACACTTCCACACTGAGATATATGCTGTCATATTTTAACTGATGATC
TSA: Cannabis sativa PK00387.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449529.1:905-926
ATCATGAGTTAAAAATATGACAGCATATAT905CTCAGTGTGGAAGTGTTTGTCTAAATCAACACATTATTAGGAATTTTCTCTG
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome X.
CP158652.1:56135162-56135183
ATCATGAGTTAAAAATATGACAGCATATAT56135162CTCAGTGTGGAAGTGTTTGTCTAAATCAACACATTATTAGGAATTTTCTCTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGACAAACACTTCCACACTGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGACAAACACTTCCACACTGAG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.134 | 0.125 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AGACAAACACTTCCACACTGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.197 | 0.063 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=CTCAGTGTGGAAGTGTTTGTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.198 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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